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Small RNA测序
产品简介

           Small RNA测序 (Small RNA 主要包括 microRNA、siRNA(small interfering RNA)、piRNA(piwi-interacting RNA)三类。Small RNA 测序是基于Illumina HiSeq2500 测序平台,研究特定组织在特定状态下的所有已知 small RNA,也可发现物种或组织特异 small RNA 并预测其靶基因,为研究 small RNA 的功能及基因调控机制提供了有力工具。

技术流程



样品要求

1)样品类型:完整且无污染的总RNA;
 
2)样品需求量:≥10 μg;
 
3)样品浓度:植物和真菌样品≥200 ng/μl;
 
4)样品纯度:OD260/280=1.8~2.2;OD260/230=1.8~2.2;28S:18S≥1.5;RIN≥8.0;昆虫样本无此指标。

案例解析

案例一:miRNA测序研究绵羊脂肪组织积贮机制[1]

    研究中对两种绵羊(小尾寒羊和陶赛特羊)的脂肪组织进行RNA-seq测序分析,共发现3132个miRNAs,其中2893个位全新miRNAs。差异表达分析共发现54个miRNAs表达存在差异,而与这些差异表达miRNAs相关的靶基因的GO和通路分析发现:miRNAs的表达量和其靶基因的表达量成负相关,小尾寒羊中miRNAs表达?#32454;擼种?#20102;脂肪组织中类脂代谢,使得小尾寒羊肉质肥美;这项研究为了解这两种绵羊脂肪储备分子机制提供了新的研究方向;


参考文献

[1]Miao X, Luo Q, Qin X, Guo Y. Genome-wide analysis of microRNAs identifies the lipid metabolism pathway to be a defining factor in adipose tissue from different sheep. Scientific Reports. 2015;5:18470. doi:10.1038/srep18470.

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