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LncRNA测序
产品简介

            lncRNA 测序(long noncoding RNA)是一类长度超过200 nt 的长链非编码 RNA,通过与 DNA、RNA 或蛋白?#24335;?#21512;,在表观遗传、转?#25216;?转录后?#20154;?#24179;调控基因表达。lncRNA 测序是研究已有参考基因组物种的特定组织或细胞在某个特定时期转录出的所有 lncRNA 和 mRNA。

技术流程


样品要求

1) 样品类型:去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA;
 
2) 样品需求量:≥10 μg;
 
3) 样品浓度:≥250 ng/μl;
 
4) 样品纯度:OD260/280=1.8~2.2;OD260/230=1.8~2.2;

案例解析

案例一:健康人中lncRNA与mRNA比较研究[1]

     本研究中对10个健康人的粒性白细胞进行mRNA和lncRNA测序,另外还对其中的7个个体在5-21周中取三次重复测序;研究发现:与mRNA相比lncRNA表达量在个体间变化更加丰富;为研究更全面的检测lncRNA数量,加入GTEx project 和GEUVADIS project的人转录组数据,发现加入的数据越多检测到新的lncRNA数量就越多,但是检测到新的mRNA的数量确变化不大,说明的lncRNA的表达不仅存在组织器官的特异表达,还存在个体特异表达,这为今后的研究lncRNA与疾病相关的分子标记和个体化医疗提供了新的研究方向。


参考文献

[1]Kornienko AE, Dotter CP, Guenzl PM, et al. Long non-coding RNAs display higher natural expression variation than protein-coding genes in healthy humans. Genome Biology. 2016;17:14. doi:10.1186/s13059-016-0873-8.
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