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基因组denovo测序
 产品简介
       近年来,高通量测序技术的迅猛发展,极大地推动了全基因组测序工作的展开,全球已有几百种的植物和动物完成了全基因组测序工作。通过全基因组测序,人们可以获得物种的全基因组序列图谱,从而为该物种后续的研究和产业化应用奠定基础。随着高通量测序技术的发展,成本的降低,动植物基因组组装不再是大牛的专利,假如您致力于该物种的深入研究,denovo测序组装它的基因组必然会推动您的研究进程。


技术流程



样品要求
          1)  样品类型:DNA;
          2)  样品浓度:≥50 ng/ul(Qubit定量);
          3)  样品总量:>60ug(Qubit定量);
          4)  样品纯度: OD 260/280介于1.7 ~ 2.2;OD260/230≥0.5;260吸收峰正常不偏移;无蛋白质、RNA污染或肉眼可见杂质污染;
          5)  若提供组织样品,则植物样本需为无菌黄化苗、组培样品或嫩叶。
注:需从同一个体取样,预防由于个体差异对后续拼接造成的影响,调研图和精细图也需要从同一个体取样;如无选取同一个体的条件,须再沟通决定取样方式。



案例解析
         花生是全世界范围内重要的油料作物,现在栽培的花生是两个野生花生物种(Arachis duranensis和Arachis ipaensis)的直接自然杂种,所以现在栽培的花生(Arachis hypogaea L.)是四倍体作物(AABB),为了绘制花生的基因组图谱,研究人员测定了两个原始亲本的基因组,两个野生种的基因组大小分别是1.2Gb和1.5Gb,根据这些序列,研究人员获得的两个二倍体野生种的序列覆盖了花生基因组的96%的基因,为快速选育抗旱和抗病虫害、低?#24230;?#21644;高产出的花生?#20998;鄭?#25552;供了所必需的分子图谱。




                                                              图 1.A. duranensis 和 A. ipaensis 的染色体共线性关系


参考文献:
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