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全基因组甲基化测序
产品简介

全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是将重亚硫酸盐处理方法和Illumina HiSeq高通量测序平台相结合,对有参考基因组的物种进行全基因组水平的甲基化研究。WGBS可以达到单碱基分辨率,精确分析每一个胞嘧啶的甲基化状态,从而构建精细的全基因组DNA甲基化图谱。

技术流程

样品要求

1)样品类型:无降解,无污染的DNA样品;
 
2)样品需求量:≥5μg;单次最低建库起始量可降至200ng;
 
3)样品浓度:≥50 ng/μl;
 
4)样品纯度:OD260/280=1.8~2.0。

案例解析

案例一:WGBS+RNA-seq揭示生殖细胞形成过程中动态去甲基化机理[1]

      人类生殖细胞形成过程中全基因组范围的去甲基化过程的研究不是很多。本研究中,对卵细胞和精子细胞成熟前53-137天取样进行RNA-seq和WGBS全基因组甲基化测序;与其它已发表的人类其它干细胞甲基化数据比较(Inner cell mass ICM,pluripotent stem cells PSC)发现:人类生殖细胞形成过程中甲基化水平和转录组表达与ICM细胞和PSC细胞存在明显差异;


参考文献

[1]Gkountela, Sofia et al.DNA Demethylation Dynamics in the Human Prenatal Germline. Cell, Volume 161 , Issue 6 , 1425 - 1436.

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