篮球小说主角是中国人
? ? 北京组学生物科技有限公司
主页 > 科技服务 > 基因组 > BSA性状定位 >
BSA性状定位
产品简介

针对研究的目标性状,选择表?#22270;?#31471;差异的亲本构建家系。利用混池分组分析法(Bulk Segregant Analysis, BSA),对该家系目标性状表?#22270;?#31471;的子代分别混合成的两个样?#22659;?#36827;行测序,同时对亲本进行测序,检测与性状相关联的位点并注释,研究基因控制目标性状的 机制。测序根据物种基因组特点可选择重测序或者简化基因组测序(Rad-seq或GBS)进行SNP等标记开发。

技术流程



样品要求

1) 样品类型:无降解且无RNA污染的DNA样品;
2) 样品需求量:小片段?#30446;?ge;2 µg;构建多次(N次)?#30446;?#25152;需DNA量:3×(N+1)µg;
3) 样品浓度:≥30 ng/µl;
4) 样品纯度:OD260/280=1.8~2.0。
 
案例解析

案例一:利用MutMap技术快速定位水稻耐盐基因[1]

       日本2011年地震引起的海啸致使>20,000 ha 水稻被海水淹没,急需培育耐盐水稻新?#20998;鄭?#32780;传统的育种方法至少需要10年以上;但是通过MutMap方法仅仅用两年的时间培育出耐盐?#20998;鄭?#24182;定位耐盐基因(hst1);该研究利用EMS诱变处理,筛选得到耐盐突变株,与野生型亲本杂交得到分离F2分离群体;运用 BSA 策略,取20株F2分离群体中的耐盐性个体进行混池,与野生型亲本 (Hitomebore)一起进行全基因组重测序,找到水稻耐盐性的基因(OsRR22)。



案例二:利用MutMap+技术揭示水稻中农艺形状相关的重要基因位点[2]

   MutMap+技术为Mutmap改进版本,主要运用在一些不利于回交性状基因的定位上,如育性,致命突变相关的基因?#29615;?#27861;主要改进在不再用突变型和野生杂交产生F2,而是直接在M2群体中找到极端性状分离株进行混池测序;本研究中,对早死并伴有植株矮小叶浅绿的突变株运用mutmap+方法,成功定位到水稻1号染色体1.49M-1.51M区间中的Os01g0127300(OsNAP6),然后,用RNAi方法结合RT-PCR方法,证实该基因在野生型和突变型中表达有显著差异。



案例三:QTL-seq:运用混池重测序快速鉴定水稻数量性状位点[3] 
  
        BSA方法定位数量性状,可快速定位主效QTL。本研究中,利用水稻稻瘟病抗性RIL群体,对极端感池和抗池各混20株样品进行测序,运用QTL-seq方法鉴定出与水稻稻瘟病抗性相关的QTL位点位于6号染色体2.39-4.39Mb区域,并且运用传统的QTL定位方法找到的区间与QTL-seq方法找到的结果相吻合,?#24471;鱍TL-seq方法可用于定数量性状的主效QTL。


参考文献

[1] Takagi H, Tamiru M, Abe A, et al. MutMap accelerates breeding of a salt-tolerant rice cultivar [J]. Nature biotechnology, 2015.
[2] Fekih R, Takagi H, Tamiru M, Abe A, Natsume S, et al. (2013) MutMap+: Genetic Mapping and Mutant Identification without Crossing in Rice. PLoS ONE 8(7): e68529. doi: 10.1371/journal.pone.0068529
[3] Takagi Hiroki, Abe Akira, Yoshida Kentaro, et al. QTL‐seq: rapid mapping of quantitative trait loci in rice by whole genome resequencing of DNA from two bulked populations[J]. Plant Journal, 2013, 74(1):174-183.

?
科技服务 技术支持 联系我们 市场活动 关于我们
篮球小说主角是中国人
重庆时时彩独胆 标准六码三期计划 手机购买彩票合法吗 pk10冠军7码一期稳赢 福彩3d稳赚不赔的技巧 时时彩单双大小有规律 北京pk10方法技巧大全 掘金北京pk拾计划软件免费 3d模拟投注器 11选5胆拖投注方法